آنالیز سریالی بیان ژن (sage) و کاربردهای آن

Authors

نسرین معتمد

nasrin motamed اسماعیل شاهسوند آنانلو

esmaeil shahsavand ananloo department of genomic psychiatry, roozbeh mental health center, num. 517, south kargar avenue, tehran, 1333795914, i.r.iran.تهران، خیابان کارگر جنوبی، شماره 517، بیمارستان روزبه، دپارتمان روان پزشکی ژنومیک

abstract

تکنیک sage یا serial analysis of gene expression روش قدرتمندی است که جهت آنالیز بیان ژن درمقیاس های وسیع بکار گرفته می شود. مجموع اطلاعات sage مشتق شده از یک نمونه ی سلولی یا بافتی تحت عنوان کتابخانه ی sage مطرح می شود، که بازتاب فراوانی همه رونوشت ها در یک نمونه در زمان مشخص می باشد. برخلاف سایر تکنیک ها، روش sage به دانش اولیه در مورد توالی های ژن مورد نظر نیازی ندارد، همچنین امکان آنالیز کمی وکیفی توالی هر رونوشت را در بافت یا سلول مورد نظر فراهم مینماید. این روش بر پایه جداسازی توالی های tag از mrna و اتصال این توالی ها بصورت سریالی به هم برای فراهم نمودن توالی یابی آنها می باشد. sage بطور گسترده در پزشکی و زیست شناسی برای آنالیز بیان ژن بکار گرفته می شود. جهت افزایش کارایی این تکنیک در شرایط بخصوص انواع تغییر یافته ای از آن با نام longsage، microsage، supersage و.... ایجاد شده است. در مقاله حاضر روش آنالیز سریالی بیان ژن، اصولی که بر اساس آنها بنا نهاده شده است، مقایسه ی sage با روش میکرواری، انواع تغییریافته آن و بخشی از کاربردهای این تکنیک شرح داده شده است.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بیان گذرای ژن در گیاهان و کاربردهای آن در کشاورزی مولکولی و شناسایی عملکرد ژن‌ها

تراریختی گذرای گیاهان روشی مفید و در برخی موارد جایگزینی مناسب برای تراریختی پایدار به ویژه در غلات، گیاهان درختی و گیاهانی است که باززایی و یا تراریختی آنها با مشکل مواجه است. در این روش در زمانی کوتاه تعداد زیادی از نسخه‌های تراژن وارد سلول گیاهی شده، رونویسی و ترجمه می‌شوند و چون توالی DNA در ژنوم میزبان وارد نمی‌شود، بیان ژن تحت تاثیر محل درج و تغییرات اپی‌ژنتیکی قرار نمیگیرد. تراریختی گذرا...

full text

بیان گذرای ژن در گیاهان و کاربردهای آن در کشاورزی مولکولی و شناسایی عملکرد ژن‌ها

تراریختی گذرای گیاهان روشی مفید و در برخی موارد جایگزینی مناسب برای تراریختی پایدار به ویژه در غلات، گیاهان درختی و گیاهانی است که باززایی و یا تراریختی آنها با مشکل مواجه است. در این روش در زمانی کوتاه تعداد زیادی از نسخه‌های تراژن وارد سلول گیاهی شده، رونویسی و ترجمه می‌شوند و چون توالی DNA در ژنوم میزبان وارد نمی‌شود، بیان ژن تحت تاثیر محل درج و تغییرات اپی‌ژنتیکی قرار نمیگیرد. تراریختی گذرا...

full text

ایمپرینت مولکولی و کاربردهای آن در آنالیز نمونه های غذایی

چکیده ایمپرینت مولکولی روشی نوین در تهیه مواد بسپاری (پلیمری) است به نحوی که ساختار نهایی دارای مکان­هایی برای شناسایی مولکول هدف می­باشد. امروزه بسپارهای ایمپرینت شده به عنوان جاذب­هایی گزینش کننده و انتخابگر در فرایندهای تجزیه ای، تشخیصی و در  سامانه های نوین دارورسانی مطرح شده اند. به طور کلی، تغلیظ و جداسازی یک ترکیب از نمونه­ی طبیعی یا آزمایشگاهی (به منظور  تجزیه کمی یا کیفی و نیز کاربردها...

full text

بررسی تفاوت بیان ژن RASGRP3 در پاسخ پرنده به آنفلوانزا نسبت به پرنده‌ی سالم با استفاده از آنالیز داده‌های بیان ژن و PCR کمی

    ژن RASGRP3 یکی از ژن­هایی است که اثرگذاری آن بر پیامد آلودگی آنفلوانزا در میزبان بسیار محتمل است.  این ژن پاسخ التهابی را کاهش داده و در واقع آستانه­ای برای ممانعت از پاسخ التهابی شدید که منجر به آسیب بافت­های میزبان می­شود، تنظیم می­نماید.  به منظور بررسی دخالت این ژن در پاسخ میزبان به آنفلوانزا از آنالیز داده­های ترنسکریپتوم موجود در پایگاه­های داده­ای و سپس PCR کمی استفاده نمودی...

full text

فراتحلیل (متا-آنالیز) داده‌های بیان ژن بافت پستان آلوده‌شده با باکتری اشریشیاکلی در گاوهای شیری

تشخیص ژن‌های درگیر در صفات پیچیده مانند حساسیت به بیماری نه تنها می‌تواند موجب بهبود تشخیص و پیشگیری از بیماری مورد نظر می‌شود، بلکه در انتخاب راه‌های درمانی کارآمد و همچنین در انتخاب دام‌های مقاوم به اصلاحگران کمک خواهد کرد. در این تحقیق با هدف بالا بردن توان تجزیۀ آماری در شناسایی ژن‌ها و مسیرهای زیستی (بیولوژیکی) درگیر در بیماری ورم پستان، از فراتحلیل به روش Fisherبرای یکی کردن p-value‌های ب...

full text

آنالیز بیان ژن داده های ماکرواری بیماری لوکمیا با برنامه DAVID

چکیده مقدمه: سرطان خون یا لوکمیا بیماری پیشرونده و بدخیم اعضای خون ساز بدن است. ناهنجاری ‌های ژنتیکی نقش بسیار مهمی در رشد لوکمی در بدن دارد. مطالعات زیادی پیرامون کشف عوامل ملکولی درگیر در این بیماری صورت گرفته است یکی از حوضه های دانش جدید در کشف بیان ژن ها در حالت بیماری استفاده از تکنولوژی ماکرواری است که یک تصویر کلی از میزان بیان ژن را در سایز بزرگ ژنومی ارائه می کند. در واقع با بررسی ت...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
genetics in the 3rd millennium

جلد ۸، شماره ۲، صفحات ۲۰۳۷-۲۰۴۲

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023